Історія розвитку факультету тісно пов’язана з розвитком університету.

Механіко-енергетичний факультет є найстарішим серед факультетів університету: його було створено разом з Харківським експлуатаційно-тяговим інститутом залізничного транспорту (пізніше Харківський інститут інженерів залізничного транспорту) у 1930р. і з початку 1930 – 1931 навчального року він почав підготовку інженерів-механіків для залізничного транспорту.

Сьогодні факультет об’єднує 6 кафедр, у тому числі 5 випускаючих: «Експлуатація та ремонт рухомого складу», «Вагони», «Електроенергетика, електротехніка та електромеханіка», «Теплотехніка, теплові двигуни та енергетичний менеджмент», «Якість, стандартизація, сертифікація та технології виготовлення матеріалів», «Механіка і проектування машин».